Lou Reed se je tik pred smrtjo zdravil z interferoni (običajno se jih povezuje z aidsom), zaradi česar so vzniknile govorice, da je bil glasbenik HIV-pozitiven. Dr. Michael Hunter pa je razkril, da je z njimi zdravil hepatitis C, s katerim se je okužil na začetku svoje kariere, ko si je heroin vbrizgaval z rabljenimi iglami.

Reed je zaradi raka na jetrih umrl oktobra leta 2013, potem ko je njegovo telo ni sprejelo presajenih jeter. Imel je 71 let.